Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms