Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALRP27797 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALRP27797 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CALRP27797 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALRP27797 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms