Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLNP26678 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PLNP26678 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms