Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms