Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT1P26358 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms