Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms