Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERBB3P21860 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms