Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms