Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELK1P19419 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELK1P19419 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELK1P19419 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELK1P19419 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELK1P19419 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms