Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms