Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG2P13521 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG2P13521 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG2P13521 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms