Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms