Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI2P10070 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI2P10070 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI2P10070 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI2P10070 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI2P10070 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms