Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYNX1P0DP58 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms