Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms