Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM10L1P0DMW3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms