Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms