Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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