Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3P05106 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms