Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB5O95377 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB5O95377 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB5O95377 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB5O95377 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB5O95377 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms