Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms