Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF6O75683 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF6O75683 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF6O75683 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF6O75683 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms