Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms