Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms