Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APAF1O14727 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APAF1O14727 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms