Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLIM4O00461 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLIM4O00461 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms