Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms