Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DGG1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DGG1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DGG1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DGG1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DGG1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms