Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VGLL3A8MV65 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms