Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYSRT1A8MQ03 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms