Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms