Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms