Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GMNCA6NCL1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms