Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms