Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VWA8A3KMH1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms