Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms