Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6BQ9UPQ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNRC6BQ9UPQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6BQ9UPQ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms