Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc6Q9R087 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc6Q9R087 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc6Q9R087 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms