Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SIPA1L2Q9P2F8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SIPA1L2Q9P2F8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
SIPA1L2Q9P2F8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIPA1L2Q9P2F8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIPA1L2Q9P2F8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms