Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN28AQ9H9Z2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN28AQ9H9Z2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms