Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF3Q9H094 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NBPF3Q9H094 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF3Q9H094 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBPF3Q9H094 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms