Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR99

4930544G11Rik, RIKEN cDNA 4930544G11, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544G11RikQ9CR99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544G11RikQ9CR99 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544G11RikQ9CR99 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544G11RikQ9CR99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms