Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rpl39lQ9CQD0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rpl39lQ9CQD0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39lQ9CQD0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rpl39lQ9CQD0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl39lQ9CQD0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Rpl39lQ9CQD0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rpl39lQ9CQD0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rpl39lQ9CQD0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpl39lQ9CQD0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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