Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB2BQ9BVA1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB2BQ9BVA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms