Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RBM42Q9BTD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RBM42Q9BTD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RBM42Q9BTD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RBM42Q9BTD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms