Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPENQ96T58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPENQ96T58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPENQ96T58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms