Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPALINQ96PE5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPALINQ96PE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPALINQ96PE5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPALINQ96PE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms