Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB4Q8WW32 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMGB4Q8WW32 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMGB4Q8WW32 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB4Q8WW32 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB4Q8WW32 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB4Q8WW32 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB4Q8WW32 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms