Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCL2Q8N4E4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL2Q8N4E4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCL2Q8N4E4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms