Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkn3Q8K045 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkn3Q8K045 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkn3Q8K045 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms